ネットでみた記事に発奮して，やってみた。
文芸的プログラミングというやつらしい。これはどうにも訳語が悪いと思うのだが，要はレポートの中に入れる数値，表，グラフなんかをプログラミングしておこうという考え方みたいだ。そのプログラムがあれば，データセットを変えるだけで何度も同様のレポートを生産することができる。いちいち数字の変更をすることなく，だ。
レポートを量産する予定がなくても，Rのコードや結果を含んだレポート，論文を書く時は便利だろう。
しかも，R studioに機能統合されているので，特に難しいことを気にせず実行できるというのがいいじゃないか。
ということで，サンプルコードを書いてみました。R，R studio, TeXの環境が整っていないと駄目ですよ，念のため。
まずはSweave。これはTeX のコードを書いて，途中にRのコードを入れるのね。R studio のFile＞New>R Sweaveと選んでいくと，Sweave用コードを書く画面が自動的に現れる。texのプリアンブルなんかももう含まれてます。
そこに書いたサンプルコードはこんな感じ。
\documentclass{article}
\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE}
Hellow World!
にほんごがかきたかったのに
<<>>=
data(iris)
head(iris)
library(mvpart)
library(randomForest)
@
<<>>=
result <- rpart(Species~.,data=iris,method=”class”)
@
\begin{figure}[!h]
\begin{center}
<<fig=TRUE,width=12,height=6,echo=T>>=
plot(result)
text(result)
@
\caption{Classfication tree of iris data}
\label{fig:ctr}
\end{center}
\end{figure}
\end{document}
で，これを「compilePDF」とするだけ。あ，ファイルはASCIIコードで保存してね。UTF-8は駄目だったなぁ。
なので，ご覧の通り，日本語は文字化けします。jsarticleじゃなくてarticle環境で書いているのですが，なんでかというとplatex2eコンパイラを使わせてもらえないから。コンパイラを該当するものに変えるには，さらに環境設定が必要みたい。今回は遊びなので，そこまで求めません。英語限定でも，Rソースとその結果がダイナミックに作れるのは嬉しいね。
ちなみに，パッケージSweaveがRstudioの中に入っているみたいなんだけど，R2.15.1に対応してないみたいなので，RstudioあるいはR，またはSweaveパッケージのバージョン違いには要注意です。
次にknitr。これは結果をhtmlで出力するのがデフォ。なぜかパッケージのインストールに手間取って，Rstudioの上からパッケージをインストールするも動かず。結局Rを直接起動して（つまりRgui.appで）install.packages(“knitr”)してからRstudioに戻ったらできた。たぶん，ライブラリパスがRとRstudioで違うんだ。後でちょっと整えておかないとな（R studioではR_LIBがどうかなってるんだろうか。よくわからん)。ともかく，Sweave同様にFile > New > R Markdownを選択。
で，やってみたのがこれ。
何もしなくても，日本語が通ります！しかも文字のサイズを変えるとか，texの数式を書くというのが簡単にできました。肝心のRコードやその結果を書くところまではいってないけど，こっちの方が簡単にできる感じかなぁ。
まだバージョン1にもなってないRstudioですが，色々今後が楽しみになってきました。