毒くらわば皿まで

rstan 2.10が来てますね。

2.9とちがって，式の代入が< -から=にすることが推奨されているようで，そうなっちゃうと今までのコードも全部書き換えないといけない。
とはいえこれから先はこうなるってんなら，早めに対応しておこうか，と母艦などのパッケージを思い切ってアップデート！

本艦のMacはすんなりアップデートでき，サンプルとして昔ながらの8schoolsを試したら，無事に走りました。もっともエラーとして，


DIAGNOSTIC(S) FROM PARSER:
Warning (non-fatal): assignment operator < - deprecated in the Stan language; use = instead.


って言われちゃいましたけどね。あー，やっぱりかー（当たり前だ）と。

で，書き直しなんだけど，よく見たら


theta[j] = mu + tau * eta[j];


だけでなく，モデルセクションも


model {
target += normal_lpdf(eta | 0, 1);
target += normal_lpdf(y | theta, sigma);
}


って変わってるのね。もとは


model {
eta ~ normal(0, 1);
y ~ normal(theta, sigma);
}

だったんですよ。

ともかくこれで走りました。コンパイルの時にちょっと警告が出たけどね。
これからは，コンパイル時のこの警告を潰していかないといけません。うう，やっと関数が出来上がったと思ったら・・・（苦笑）

Warning (non-fatal): assignment operator <- deprecated in the Stan language; use = instead.
Warning: Deprecated function 'normal_log'; please replace suffix '_log' with '_lpdf' for density functions or '_lpmf' for mass functions

ついでに，とMacの上の仮想Windowsは，っとみたら，Rが3.2で止まってた。R3.3.1にあげて，rstanもアップデートする。

ここでRtoolsのバージョン違いがあってうまくいかなかった。最新版Rtools34はダメみたいで，Rtools33にしか対応してないみたい。でそこからが大変。コンパイル系のエラーが出まくって，rstanがうまく入りません！

仕方がないので，RもRtools33もRstudioもぜんぶアンインストール＆再インストールしてから，install.packages("rstan")した。コンパイル時になんか警告が出たっぽいけど，これでやっとインストールできました。
ちなみにrstudioapiとかcolorなんとかってパッケージが入らないみたいで，要求されるままに手動で入力。ちょっと面倒だったな。今度学生に準備させるんだけど，事前に練習しておいてよかったよ・・・。

最後に　Ubuntu。久しぶりに起動したので，システムそのもののアップデートをして，インストール。何だかうまくいかなかったんだけど，最終的にソースからコンパイルするとうまく走りました。Windowsより簡単ではあったな。

ともあれ，よいこのみんなは締め切りが迫っている中，環境を変えるのは良く無いってことを覚えておこうね！